使用 Dataset 定义数据集¶
这个世界上的数据集五花八门,并且总是以不同的格式(比如 png, HDF5, npy 等)分布在不同地方, 或许一些数据集的存储和组织形式已经成为了参考标准,但并不是所有数据一开始都用 MegEngine 所支持格式的进行存储, 很多时候需要我们写脚本借助一些库或框架对原始数据进行处理,并且转换成 MegEngine 中可用的数据集对象。
在 如何创建一个 Tensor 小节中,我们提到了 ndarray 是 Python 数据科学社区中较为通用支持的格式,
因此 MegEngine 中的数据集相关操作均以 NumPy 的 ndarray
作为处理对象
(此时假设用户已经通过一些途径将原始数据转换成了 ndarray 格式,能够用作后续数据集封装),
整个过程中数据格式不会自动转换,因此需要注意:后续如果要进行 Tensor 计算时,则需要 将 NumPy ndarray 转化为 MegEngine Tensor 。
参见
通过搜索引擎搜索类似 “如何用 NumPy 加载 xxx 类型数据?” 等问题会很有帮助。
注解
DataLoader
初始化时必须提供dataset
参数,通过传入一个数据集对象,告知如何加载每个数据;MegEngine 中可以 使用已经实现的数据集接口 (如
PascalVOC
,ImageNet
等) 替用户完成一些主流数据集的获取、切分等工作。但一些时候这些实现不能满足需求,或者我们需要使用自己采集和标注好的数据集, 因此在使用DataLoader
之前,通常需要将要用到的数据集人为地封装。
数据集类型¶
根据样本的访问方式, MegEngine 中的数据集类型可分为 Map-style 和 Iterable-style 两种:
类型 |
||
抽象基类 1 |
||
访问方式 |
支持随机访问 |
仅能顺序迭代 |
适用情景 |
Numpy 数组、字典、磁盘文件 2 |
生成器、来自网络的流数据 |
- 1
这些类不可直接实例化使用,对应类型的数据集必须自定义子类进行继承,并实现必需的协议。
- 2
通常应该尽可能使用 Map-style 的数据集。它提供了查询数据集的大小的方法,更容易打乱,并能够轻松地并行加载。 但
MapDataset
不太适合输入数据作为流的一部分到达的情况,例如音频或视频源; 或者每个数据点可能是文件的一个子集,该文件太大而无法保存在内存中,因此需要在训练期间进行增量加载。 虽然这些情况可以通过往 Map-style 数据集中加入更复杂的逻辑或在输入时进行额外的预处理来解决, 但也会花掉更多的准备时间,现在有一个更自然的解决方案,即使用 Iterable-style 的StreamDataset
作为输入。
Map-style¶
Dataset
(也可被称为MapDataset
)MegEngine 中所有数据集的抽象基类。 对应数据集类型为 Map-style, 即表示从索引/键到数据样例的映射,具有随机访问能力。 例如使用
dataset[idx]
可以从磁盘上的文件夹中读取到第idx
个图像及其相应的标签。 使用时需要实现__getitem__()
和__len__()
协议。下面的代码展示了如何生成一个由 0 到 5 这五个数组成的数据集(不带标签):
from megengine.data.dataset import Dataset class CustomMapDataset(Dataset): def __init__(self, data): self.data = data def __getitem__(self, idx): return self.data[idx] def __len__(self): return len(self.data)
>>> data = list(range(0, 5)) >>> map_dataset = CustomMapDataset(data) >>> print(len(map_dataset)) >>> print(map_dataset[2]) 5 2
警告
请注意,为了避免在加载大型数据集时试图一次性将数据加载到内存而导致 OOM(Out Of Memory), 我们建议将实际的数据读取操作实现在
__getitem__
方法中,而不是__init__
方法中, 后者仅记录映射关系中的索引/键内容(可能是文件名或路径组成的列表),这可以极大程度地减少内存占用。 具体的例子可参考 举例:加载图像分类数据 ;如果数据规模已经大到了无法将索引等 meta 信息加载进内存,则需要考虑流式获取方式;
但情况并不总是唯一的。如果我们的数据集规模比较小,可以常驻在内存中, 那么就可以考虑在初始化对象时就加载好整个数据集,减少反复从硬盘或其它位置读取数据到内存的次数。 例如在不同的 Epoch 中,同一个样本会被用来训练多次,此时从内存中直接读取会更加高效。
ArrayDataset
对
Dataset
类的进一步封装,适用于 NumPy ndarray 数据,无需实现__getitem__()
和__len__()
协议。下面的代码展示了如何生成随机一个具有 100 个样本,每张样本为 32 x 32 像素的 RGB 图片的数据集(标签为随机值) 这也是我们在处理图像时经常遇到的
(N, C, H, W)
格式:import numpy as np from megengine.data.dataset import ArrayDataset data = np.random.random((100, 3, 32, 32)) target = np.random.random((100, 1)) dataset = ArrayDataset(data, target)
>>> print(len(dataset)) >>> print(type(dataset[0]), len(dataset[0])) >>> print(dataset[0][0].shape) 100 <class 'tuple'> 2 (3, 32, 32)
ConcatDataset
由多个数据集组成的数据集。 这个数据集用于将多个映射式(map-style)组合为一个新的数据集。
下面的代码展示了如何将多个
ArrayDataset
组合成一个ConcatDataset
数据集:import numpy as np from megengine.data.dataset import ArrayDataset, ConcatDataset data1 = np.random.randint(0, 255, size=(100, 3, 32, 32), dtype=np.uint8) data2 = np.random.randint(0, 255, size=(100, 3, 32, 32), dtype=np.uint8) label1 = np.random.randint(0, 10, size=(100,), dtype=int) label2 = np.random.randint(0, 10, size=(100,), dtype=int) dataset1 = ArrayDataset(data1, label1) dataset2 = ArrayDataset(data2, label2) dataset = ConcatDataset([dataset1, dataset2])
>>> print(len(dataset)) >>> print(type(dataset[0]), len(dataset[0])) >>> print(dataset[0][0].shape) 200 <class 'tuple'> 2 (3, 32, 32)
Iterable-style¶
StreamDataset
(也可被称为IterableDataset
)Iterable-style 数据集,适用于流式数据,即迭代式地访问数据, 例如使用
iter(dataset)
可以返回从数据库、远程服务器甚至实时生成的日志中读取的数据流,DataLoader
将使用next
来不断获取数据。这种类型的数据集特别适用于:
随机读取成本过高,或者数据规模太大,无法支持随机访问的情况;
批量大小情况实际取决于获取数据的情况,即必须根据流数据才能判断当前批是否已经完整。
使用时需要实现
__iter__()
协议。下面的代码展示了如何生成一个由 0 到 5 这五个数组成的数据集(不带标签):
from megengine.data.dataset import StreamDataset class CustomIterableDataset(StreamDataset): def __init__(self, data): self.data = data def __iter__(self): return iter(self.data)
>>> data = list(range(0, 5)) >>> iter_dataset = CustomIterableDataset(data) >>> it = iter(iter_dataset) >>> print(type(it)) list_iterator >>> print(next(it)) 0 >>> print(next(it)) 1
显然,流式数据集不支持获取长度以及通过索引值进行随机访问:
>>> iterable_dataset[0] AssertionError: can not get item from StreamDataset by index
>>> len(iterable_dataset) AssertionError: StreamDataset does not have length
这个例子无法体现
StreamDataset
加载的真实需求情景,但方便和MapDataset
进行对比。
为何设计流式数据集¶
Map-style
>>> for data in map_dataset:
... print(data)
0
1
2
3
4
Iterable-style
>>> for data in iter_dataset:
... print(data)
0
1
2
3
4
根据上面的例子可以发现,使用相同的原始 List 数据来生成两种类型的数据集并迭代访问,
Map-style 和 Iterable-style 的数据集都能够返回相同的结果,那么区别在哪里呢?
从高层视角看,每次 DataLoader
从 Map-style 数据集中返回批数据时,
它都会先对数据索引进行采样得到一批索引 idx
, 并使用 map_dataset[idx]
获得批数据.
相反,对于 Iterable-style 数据集,DataLoader
不断地调用 next(it)
来顺序获取下一个数据,
直到它获取到一个完整的批次。这也是为什么我们说 Iterable-style 数据集更适合将数据提供给顺序模型。
参见
参考 使用 Sampler 定义抽样规则 ,了解如何从样本容量为 N 的数据集中得到长度为 B 的一批索引。
使用已经实现的数据集接口¶
在 dataset
子模块中,除了提供了一些抽象基类待用户自定义子类进行实现,
还提供了一些基于主流数据集封装好的接口,比如常被用于教学和练习用途的 MNIST
数据集:
>>> from megengine.data.dataset import MNIST
>>> train_set = MNIST(root="path/to/data/", train=True, download=False)
>>> test_set = MNIST(root="path/to/data/", train=False, download=False)
借助于封装好的接口,我们可以快速的获取 MNIST 数据集的训练集 train_set
和测试集 test_set
,
其中 download
参数可以控制是否要从数据集官方提供的地址进行下载。更多细节请参考 API 文档。
警告
这些数据集都是从它们自己的官方站点进行下载的,MegEngine 不提供镜像或加速服务。
注解
一些数据集由于许可协议中的规定将不提供原始数据的下载接口(如
ImageNet
),需手动下载;下载速度受到网络环境和带宽的影响,用户也可以选择使用其它的脚本或工具下载原始数据集;
这些数据集接口源码是非常不错的参考,对于帮助用户学习如何设计数据集接口会很有帮助。
如何添加新的数据集¶
目前 MegEngine 中提供了一些常见的主流数据集接口,也欢迎用户为我们提供更多的接口实现。
但目前我们还没有提供明确的设计规格和要求,因此建议用户先尝试与官方维护人员进行交流。